Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pde6aP27664 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde6aP27664 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms