Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfb2P27090 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgfb2P27090 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms