Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U2af2P26369 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U2af2P26369 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms