Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pde6bP23440 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pde6bP23440 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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