Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PparaP23204 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PparaP23204 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PparaP23204 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PparaP23204 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PparaP23204 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PparaP23204 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PparaP23204 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PparaP23204 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms