Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Eif3aP23116 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Eif3aP23116 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms