Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tap1P21958 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tap1P21958 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tap1P21958 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tap1P21958 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tap1P21958 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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