Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TP20293 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TP20293 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TP20293 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TP20293 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TP20293 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TP20293 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TP20293 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TP20293 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TP20293 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TP20293 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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