Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NefhP19246 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NefhP19246 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NefhP19246 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NefhP19246 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms