Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Csn1s1P19228 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Csn1s1P19228 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms