Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18529 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18529 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18529 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms