Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtsdP18242 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CtsdP18242 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms