Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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PtpraP18052 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtpraP18052 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PtpraP18052 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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