Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RhoP15409 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms