Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54P14576 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54P14576 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54P14576 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54P14576 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srp54P14576 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54P14576 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms