Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Vpreb2P13373 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms