Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd4P10628 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd4P10628 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms