Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CatspereP0DP43 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CatspereP0DP43 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms