Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P06330 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P06330 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P06330 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms