Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01820 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01820 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01820 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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