Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01666 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01666 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P01666 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms