Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sp1O89090 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sp1O89090 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Sp1O89090 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Sp1O89090 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sp1O89090 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sp1O89090 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sp1O89090 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sp1O89090 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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