Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms