Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfdp1O88271 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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