Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms