Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ldb2O55203 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ldb2O55203 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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