Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copb2O55029 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms