Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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BckdkO55028 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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BckdkO55028 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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BckdkO55028 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
BckdkO55028 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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