Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DffaO54786 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
DffaO54786 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
DffaO54786 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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