Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FxnO35943 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FxnO35943 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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FxnO35943 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FxnO35943 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FxnO35943 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FxnO35943 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FxnO35943 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms