Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek2O35942 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nek2O35942 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms