Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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