Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lhx8O35652 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms