Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stag2O35638 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms