Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn1mwO35599 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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