Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Foxd2O35392 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms