Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpsf2O35218 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpsf2O35218 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms