Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ArxO35085 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ArxO35085 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ArxO35085 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ArxO35085 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ArxO35085 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ArxO35085 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ArxO35085 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ArxO35085 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ArxO35085 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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