Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Q1O19441 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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H2-Q1O19441 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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H2-Q1O19441 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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H2-Q1O19441 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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H2-Q1O19441 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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H2-Q1O19441 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H2-Q1O19441 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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H2-Q1O19441 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Q1O19441 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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