Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Eftud2O08810 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Eftud2O08810 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms