Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltaO08585 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltaO08585 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltaO08585 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltaO08585 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms