Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sec22bO08547 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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