Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efna3O08545 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Efna3O08545 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms