Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
MsmbO08540 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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