Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp35M0QWN7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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