Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm3239L7N2D9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm3239L7N2D9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm3239L7N2D9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3239L7N2D9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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