Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21310J3QQ23 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21310J3QQ23 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms