Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm20795J3QP49 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms