Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim18J3QNP2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim18J3QNP2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim18J3QNP2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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