Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc180J3QNE4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms